厦航主营国内航空客货运输业务、福建省及其他经民航总局批准的指定地区始发至邻近国家或地区的航空客货运输业务，航空公司间的业务代理，兼营航空器维修、航空配餐、酒店、旅游、广告、进出口贸易等业务。厦航以厦门、福州、晋江、武夷山、杭州、南昌为航班始发的营运基地，经营至全国各大中城市以及新加坡、马来西亚、泰国、日本、韩国等140多条国内、国际航线，年运输旅客超过700万人次。公司在境内外四十几个大中城市设立了办事处和营业部。

发展历史

　　2006年，厦航共安全飞行138，712小时，飞行事故征候万时率继续保持0记录，第五次迎来了代表航空安全最高荣誉的“金鹰杯”，同时获得连续安全飞行一百万小时的“飞行安全一星奖”两项大奖。自中国民航总局1995年开始设立航空安全流动奖杯的12年来，厦航先后8次捧杯，继1998、2001年获得“金鹰杯”后又于2004至2006年连续3年夺杯。此前，厦航在1995～1997年连续3年夺得航空安全“金雁杯”，获得“航空安全金雁杯三连贯”荣誉，实现了 “金雁”、“金鹰”两杯双双落户厦航，这在中国民航界是没有先例的。充分显示了厦航安全基础管理的卓越成就。厦航的空中和地面服务双双荣获民航总局和共青团中央授予的全国级“青年文明号”。

　　厦航机务部经民航适航管理部门审查批准，可从事B757飞机C8检、B737/B757飞机的C4检和中检、B737/B757飞机的航线维修、"C"检（含）以下的各级定期维修、发动机更换、JT8D-17型发动机的热检、刹车组件的修理、APU的热检以及无损探伤等维修项目。

　　厦航自成立就自主经营，拥有自己的承运人代码，是国际航空运输协会的正式会员。迄今已形成了一套适合自身特点的行之有效的经营管理机制，塑造出“安全、优质、诚信”的品牌。厦航不仅给股东带来了丰厚的回报，也为社会做出了贡献，是我国民用航空体制改革初步尝试的成功典范。